临床医学研究(临床医学研究期刊)



临床医学研究,临床医学研究期刊

2022年9月17日,由安诺优达主办的“多组学在肿瘤领域中的应用研讨会”在京召开。肿瘤专家齐聚一堂,围绕多组学技术在肿瘤基础研究、精准诊断和临床应用中的现状和前景展开了深入的学术探讨和交流。本次大会主席由安诺优达CEO李志民先生和中国医学科学院肿瘤医院王成锋教授共同担任,会议吸引了众多国内外知名专家、学者以及行业相关企业PacBio、Illumina的共同参与,是一场不容错过的学术盛宴。

一. 嘉宾致辞

图:致辞嘉宾 安诺优达CEO李志民先生(左)和中国医学科学院肿瘤医院王成锋教授(右)

(来源/安诺优达,下同)

安诺优达CEO李志民先生在致辞中表示,随着基因测序技术的发展,多组学技术在肿瘤发生发展机制研究过程中起到了非常重要的作用,安诺优达有幸在这个领域耕耘了十年。未来,将继续为科研客户提供多种组学的解决方案,帮助客户取得重要的科研成果。

中国医学科学院肿瘤医院王成锋教授在致辞中表示,肿瘤的发病机制都不是单一因素引起的,让肿瘤的研究变得格外的复杂而又充满挑战。此次肿瘤会议为国内外专家和学者提供了一个很好的交流和合作的平台,众多国内外的专家学者分享和讨论在肿瘤领域的研究和探索,进一步推动多组学测序技术在肿瘤基础科学和临床医学领域的应用。

图:线下部分与会报告嘉宾

二. 主题报告

中国医学科学院肿瘤医院杜永星博士:《胰腺癌中结构变异与染色质三维结构的动态互作研究》

中国医学科学院肿瘤医院王成锋主任团队采用三代SMRT长读长的测序技术,建立了胰腺癌细胞系中结构变异的全景图谱,同时联合Hi-C和转录组测序等多组学技术揭示了胰腺癌细胞中染色质三维构象的多尺度重塑,并阐明了结构变异与染色质三维结构之间复杂的动态互作,为理解胰腺癌中结构变异的致病机理提供了丰富的资源,此研究已成功发表在国际知名杂志Advanced Science,并入选当期的内封面文章。

四川大学华西第二医院周圣涛教授:《多组学技术在肿瘤微环境研究中的应用》

周圣涛教授结合自己多年的肿瘤微环境研究经验分享了采用比较蛋白质组学技术结合生物信息学技术研究STAT4对卵巢癌发生发展的作用、采用转录组学测序技术研究卵巢癌四种分型中预后最差的间充质亚型(Mesenchymal subtype)、肿瘤靶向治疗新策略等多项精彩纷呈的研究。

中国医学科学院肿瘤医院刘明洋研究员:《胰腺癌侵袭转移及耐药机制研究》

刘明洋研究员为大家分享了一个重要ZIP4研究靶标。ZIP4是一个锌转运蛋白,可以影响胰腺癌的发生、转移、化疗耐药和预后。目前刘明洋研究员正在采用单细胞转录组学、转录组学、蛋白质学等组学技术开展胰腺癌相关的多项研究。

中国医学科学院肿瘤医院李文斌副研究员:《多组学在肺癌分子病理诊断中的应用》

李文斌副研究员主要为大家分享了多组学在非小细胞肺癌中的精准诊断和在人群中罕见靶点细分领域的应用,为基础研究转化到临床方面提供了新的思路和启示。也为多组学技术在临床的应用提供了重要的参考。

安诺优达苑赞经理:《安诺优达三维基因组产品与合作项目介绍》

苑赞经理为大家详细介绍了安诺优达三维基因组研究技术的发展历程。系统总结了基因组结构变异和染色质结构蛋白改变对癌症发生发展的影响。介绍了安诺优达于2015年在国内推出了Hi-C产品后,一直致力于三维基因组测序产品的研发。2019年连续3次技术升级先后推出了10万、1万、1千细胞的低起始量Hi-C建库产品。2021、2022年安诺优达连续帮助多位合作者发表高水平肿瘤三维基因组研究。2022年,安诺优达参与的染色体重排哺乳动物模型研究发表在Science。同时,安诺优达公司也一直致力于三维基因组原创算法的更新和应用,目前更是积累了3000+的Hi-C产品建库和数据分析经验。

中山大学肿瘤防治中心郑健研究员:《RNA-蛋白互作介导的肿瘤表观调控》

郑健研究员分享了RNA-蛋白互作介导的肿瘤表观调控的研究。研究表明,RNA-蛋白质互作与恶性肿瘤密切相关,涉及肿瘤生理和病理进程中多个关键信号通路的改变。

北京大学第三医院潘恒研究员:《血液肿瘤的DNA甲基化异常研究》

潘恒研究员的研究方向主要是用表观遗传学数据研究肿瘤的演化,并以此为基础实现患者的分层,进而了解和治疗肿瘤。潘恒研究员发现了一种可以找到甲基化癌症驱动基因的计算生物学的方法-MethSig,此项研究的结果已发表在权威期刊Cancer Discovery中。

Genome Biology杂志副编辑佘文静:《Publishing with Genome Biology》

佘文静副编辑从编辑的角度为大家分享了在发表文章和投稿过程中容易被忽略的细节,例如研究思路的设计和结果分析的方法是否具备新颖性,影响力和可读性等特点。是否书写了清晰的摘要和cover letter。同时介绍了Genome Biology期刊的文章类型,为投稿者讲解了投稿的周期、审稿的流程等信息。

军事科学院军事医学研究院陈河兵副研究员:《从三维基因组视角看肿瘤的发生发展》

陈河兵副研究员基于TAD寻找靶标,通过对TAD边界改变和转录异常的研究来筛选癌基因。同时研究基因组结构变异与染色质三维结构改变的因果关系,进而探索胰腺癌发生发展的机制和肿瘤组织中层级结构的变化。

北京协和医院任博博士:《胰腺癌侵袭转移与三维基因组》

任博博士聚焦于研究表观遗传学在胰腺癌侵袭转移中的分子机制。任博博士通过Hi-C构建染色质的三维结构,通过各种组蛋白的修饰和ChIP-seq研究表观的调控元件,通过ATAC-seq研究染色质可及性,通过RNA-seq检测基因的表达,继而寻找胰腺癌侵袭转移中三维基因组改变的关键过程。结果表明,胰腺癌侵袭转移中存在多维度的三维表观基因组重编程,多种表观遗传重编程机制协同促进胰腺癌侵袭转移。

美国UPMC医学中心赵林桔博士:《胶质瘤肿瘤微环境和免疫治疗》

赵林桔博士的研究对象是致死率和发病率都很高的一种中枢神经常见肿瘤胶质瘤,对48个病人来源的肿瘤干细胞进行RNA-seq和ChIP-seq测序,锁定了对GSC特异的染色质调控因子YY1,研究结果表明YY1在体外可以很好地抑制肿瘤的增殖,在小鼠体内也可以减慢肿瘤的生长速度,延长小鼠的生存期。同时赵林桔博士也研究了肿瘤免疫微环境对胶质瘤细胞表型的影响。

安诺优达李华云经理:《转录组在临床医学中的深度应用》

李华云经理介绍了安诺优达转录组测序的产品类型。从转录组在人类疾病中应用的案例来解析转录组测序技术在解析表达谱,鉴定融合基因,研究可变剪切和等位特异表达等方面的应用,帮助研究者从全新的视角在临床医学中应用转录组测序技术。最后李华云经理介绍了安诺优达多样化的测序服务平台、“安诺云“大数据分析平台、医学大项目团队等,可以为客户提供具有高质量的测序分析服务。

PacBio 公司市场副总监Jonathan Bibliowicz 博士:《HiFi精准长读长测序与更完整的肿瘤基因组学解决方案》

Jonathan Bibliowicz 博士介绍了PacBio公司的HiFi长读长测序的特点,读长可达20kb,具有高序列精度和覆盖度。Jonathan Bibliowicz也介绍了这一技术在癌症研究中的应用,与短读长测序比较,通过长读长的测序可以鉴定出基因的点突变,很好地鉴定出基因组的SVs。通过全长转录组测序,可以揭示新的基因融合,更好地解析转录水平发生的可变剪切,发现更多的、可作为癌症生物标记物和药物靶点的异构体。

因美纳(Illumina)公司资深应用市场经理彭闱砚:《单细胞多组学:多维度分析每一个样本》

彭闱砚经理根据目前的研究热点为研究者总结了目前国内外研究中常见的单细胞多组学的方法,首先是应用单细胞表观遗传和转录组(scATAC-seq和mRNA-seq),其次是单细胞转录组和蛋白质组(CITE-seq)的联用。最后是单细胞基因组和蛋白质组联用。值得注意的是,因美纳公司在以上介绍的多种方案的多组学研究中,都有相应的配套平台和解决方案。

图:会议现场

三. 会议闭幕

最后,中国医学科学院肿瘤医院王成锋教授发表了会议总结致辞,本次大会为致力于肿瘤研究的专家学者提供了很好的交流平台,也提出了很多引人深思的问题,期待未来大家能够增进合作,共同推动肿瘤基础研究和临床应用的发展。也期待多组学测序技术能在肿瘤的发病机制,诊断治疗等方面的研究取得更大的科学进展,用科技和创新提升生命品质!与会专家表示,多组学测序技术在肿瘤基础科学和临床医学中大有可为。

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关于安诺优达

安诺优达基因科技成立于2012年,总部位于北京,在北京、义乌、上海设立医学检验实验室,是中国基因组行业的平台型企业。安诺优达一直深耕人类医学健康和生命科学研究两大领域,建立了专业的检测与数据分析平台,积极推动基因科技的产业化应用,助力生命科学发展。在科技服务领域,安诺优达通过多组学技术,和国内外高校院所和研发机构广泛开展科研合作,已在Nature、Science、Cell、Nature Genomics等权威期刊合作发表文章上百篇。目前在单细胞多组学、三代测序、复杂基因组组装、泛基因组组装和疾病分子机制探究等研究领域,安诺优达已形成特色技术优势,为生命科学研究提供优质的整体解决方案。

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